用trizol法提取RNA的方法及每一步的原理.
实验步骤:
1. 提取组织RNA时,每50~100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解:提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5~106个细胞加1ml Trizol后,反复用枪吹打或剧烈震荡以裂解细胞;
2. 将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在试问15~30℃下放置5分钟;
3. 在上述EP管中,按照每1mlTrizol后加0.2ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15~30℃)放置2~3分钟后,12000g(2~8℃)离心15分钟;
4. 去上层水相置于新EP管中,按照每1mlTrizol加0.5ml异丙醇的量加入异丙醇,在室温下(15~30℃)放置10分钟后,12000g(2~8℃)离心10分钟;
5. 弃上清,按照每1ml Trizol加1ml75% 乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g(2~8℃)离心5分钟,弃上清;
6. 让沉淀的RNA在室温在自然干燥;
7. 用Rnase-free water 溶解RNA沉淀
各试剂的作用:
1、 TRIZOL
主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)。
TRIZOL是从细胞和组织中提取总RNA的即用型试剂,在样品裂解或匀浆过程中,TRIZOL能保持RNA完整性。加入氯仿后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相,用异丙醇可沉淀回收RNA。
※0.1%的8-羟基喹啉可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用。
※异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。
※β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键。
2、 氯仿
为有机溶剂与水互不相溶,RNA(核糖核“酸”的盐型)是离子化合物,溶于水相
3、异丙醇
能与与任意比例的水混合,因此加入异丙醇,能够夺取RNA/DNA周围的水分,RNA/DNA能够聚集而发生沉淀。
双链RNA提取方法以及每一步的原理是什么
真菌菌丝的总RNA的提取
RNA提取缓冲液(CTAB):2%
CTAB(W/V),2%
聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100
mM
Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25mM
EDTA,
0.5g/L
亚精胺Spermidine,2.0M
NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)。由于在高温灭菌条件下,Tris-HCl要和DEPC发生反应,所以配RNA提取缓冲液时直接用DEPC
处理的水配制即可。
SSTE:1
M
NaCl,0.5%
SDS(W/V),10
mM
Tris-HCl
pH8.0,1.0
mM
EDTA
10M
LiCl
直接用蒸馏水配10M
LiCl,加1‰的DEPC过夜后,高温灭菌。
3M
NaAc
氯仿:异戊醇(24:1)
酚(pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)
DEPC处理水
用1‰的DEPC处理蒸馏水过夜,高温灭菌
无水乙醇
70%酒精
1.
实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇)(10mL加80ul,50mL中加入300ul)。
2.取约0.8g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可!固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50
mL离心管,按1g材料8mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀。
3.
65℃水浴3-10
min,期间混匀2-3次
4.
加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提(10,000
rpm,4℃,5
min)
5.
取上清,等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提(10,000
rpm,4℃,5
min)
6.
加入1/4V体积10M
LiCl溶液,4℃放置6hr以上(或过夜)
7.
10,000
rpm,4℃离心20
min
8.
弃上清,用500
ulSSTE溶解沉淀
9.
酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提两次,
氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000
rpm,4℃,5
min)
10.
加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30
min以上
11.
12,000
rpm,4℃离心20
min
12.
弃上清。沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥
13.
加200
ul的DEPC处理水溶解
14.
用非变性琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计扫描检测RNA的质量
(在抽提过程中,若蛋白质含量或其它的杂质还较多,可以增加抽提次数)
注意:提取RNA请尽量在低温下操作,如果条件不容许,在室温下操作的时间要尽可能的短。
怎样从总RNA中提取mRNA?原理是什么?
大多数真核细胞mRNA的3’端通常具有由20-30个腺苷酸组成的polyA尾巴,寡聚胸腺嘧啶脱氧核糖核苷(OligoT)可以与之配对结合,这就是提取mRNA最基本的原理。具体到实验手段上,现在磁珠法、纤维素柱层析法都有在用。
磁珠法一般是用生物素标记OligoT,亲和素标记磁珠(生物素和亲和素间具有高度亲和力)。实验时生物素标记的OligoT与mRNA的polyA高效杂交形成复合体,此复合体又与标有亲和素的磁珠结合。用磁性分离架就可以将这堆复合物分离出来。最后用无RNase去离子水将mRNA从复合物中洗脱下来即可。
寡聚dT纤维素柱层析法的大致流程:总RNA流经寡聚dT纤维素柱时,在高盐缓冲液中,带polyA尾的mRNA被特异地结合在柱上。降低盐浓度,mRNA被洗脱。一般过两次柱后,就可得到较高纯度的mRNA。
当然有些mRNA没有polyA尾巴,这种就比较难办了,我最近的实验就是在对付这种东西。如果你是拿mRNA做RT-PCR,其实一般是不必分离mRNA的,设计好引物就可以用总RNA做了。
RNA提取原理
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:
Trizol是一种总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解细胞,抑制细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。
Trizol作用原理:
在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成分。加入氯仿离心后,裂解液分层成水相和有机相。RNA存在于水相中。
水相转移后,RNA通过异丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可从中间相沉淀得到DNA,加入异丙醇沉淀可从有机相得到蛋白质。
扩展资料:
抽提RNA的使用目的
RNA用于不同的后续实验,其质量要求不尽相同。
cDNA文库构建要求RNA完整而无酶反应抑制物残留;
Northern对RNA完整性要求较高,对酶反应抑制物残留要求较低;
RT-PCR对RNA完整性要求不太高,但对酶反应抑制物残留要求严格。因此,明确实验目的是进行后续实验的首要条件。
参考资料来源:百度百科-RNA
trizol法提取rna原理是什么?
Trizol作用原理:
在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成分。加入氯仿离心后,裂解液分层成水相和有机相。RNA存在于水相中。
水相转移后,RNA通过异丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可从中间相沉淀得到DNA,加入异丙醇沉淀可从有机相得到蛋白质。
扩展资料
RNA和DNA一样,也是由各种核苷酸通过3′,5′-磷酸二酯键连接构成的多核苷酸链,但与DNA有一系列差异。
1、在化学组成方面,RNA含核糖而不含脱氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每个tNA分子含有一个胸腺嘧啶,这是在RNA链合成后由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少数DNA含有少量核糖,但这些个别的例外并不能以此否定两类核酸组成上的差异。
2、RNA一级结构的概念虽与DNA相同.但其基本结构单位是核糖核苷酸而不是脱氧核糖核苷酸。此外,部分RNA5′端或3′端有特殊的核苷酸序列,而且RNA一级结构中没有DNA那样复杂的顺序组织。
3、绝大多数RNA为单链分子,单链可自身折迭形成发夹(hairpin)样结构而有局部双螺旋结构的特征,这是各种RAN空间结构的共同特征。RNA局部双螺旋结构中碱基互补配对规律是A对U和G对C。由于RNA分子内部不能全面形成碱基配对,故其碱基克分子比A不等于U,G不等于C,不存在DNA碱基比例的 Chargaff规律。
实验1:总RNA的提取——Trizol
实验一:细胞中总RNA的提取及鉴定
一、目的:
掌握Trizol提取总RNA的原理和步骤,学习电泳鉴定总RNA的方法。
二、原理:
RNA是核酸,具有较好的水溶性。提取RNA首先破碎细胞,然后用提取液将RNA溶出,反复抽提去除蛋白质,加入乙醇沉淀RNA,将RNA沉淀溶解备用。
常用的试剂为Trizol,该试剂可以破坏细胞使RNA释放出来的同时,同时使RNA酶变性失活,保护RNA的完整性。Trizol的主要成分为异硫氰酸胍、酚和B-巯基乙醇,异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,并使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。提取中加入氯仿,主要用处是用来分相,加速有机相和水相的分层,上层为水相,PH 5.1左右,只有RNA分子留在水相,DNA分子沉淀在酚与溶液的界面。加入异丙醇,主要沉淀大分子rRNA和mRNA。最后加入乙醇主要是洗涤异丙醇,也可以溶解一部分蛋白,去除杂质。
判断RNA 的质量主要有两个标准,一是完整性(是否被降解),二是纯度。RNA的完整性主要通过电泳分析来阐明,未降解的总RNA电泳时在凝胶中会出现28S、18S和5S rRNA对应的条带,如果有DNA污染则在RNA后会发现基因组DNA对应的条带。RNA的纯度可以通过分光光度计进行测定的A260/A280值来判断。
三、步骤:
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